（1）网络基础设施落后。我国的网络基础设施落后，制约着我国电子商务的发展。主要表现在：网络带宽狭窄、接入技术落后、接入速率较低、网络运行质量差、电信费用高，特别是作为电子商务平台的送递和结算基础落后，不能提供国产的电子商务所需的软硬件产品及技术服务等。
（2）缺乏可靠的安全机制。安全是保证电子商务健康有序发展的关键因素。目前网络安全在全球还没有形成一个完整体系。我国有关电子商务的安全技术的强度普遍不够，安全管理存在很大隐患，需要努力解决。
（3）企业和消费者对电子商务的观念和认识上的问题。近年来，尽管电脑网络已成为很多企业竞相涉足的领域，不少企业也都有了自己的域名和网站。但是企业信息化建设滞后，管理体制和运行机制尚未转变，观念上也未能把信息化作为企业自我发展的内在需求和提高企业竞争力的有效途径。致使企业信息化总体水平不高，各项业务流程尚未优化重整，组织结构、管理运行模式不能适应电子商务发展的需要。
一方面，我国的电子商务应用尚处于初级阶段，发展水平和层次有限，还不能给广大企业和消费者带来明显的好处，难以吸引他们“上网”；另一方面，大量的企业和消费者，由于对Internet和电子商务缺乏认识，更由于观念上的落伍以及其他原因，对上网和应用电子商务没有兴趣，因此使得我国的电子商务市场难成气候。
（4）缺乏安全的电子支付手段。电子商务的优势在于能使企业及消费者零距离付款，零距离购物消费。但如果没有安全有效的电子支付手段是做不到的。
（5）物流现代化水平低。除了少数无形或媒体商品外，绝大多数商品都必须解决交割问题，解决与电子商务应用方式有关的速度、质量和成本问题，以及如何安全可靠地把货物从甲地送到乙地的问题。这要求与之配套的商业自动化、商业信息化和物流现代化，否则，只能是“网上谈兵”。
（6）尚无健全的标准和法规。网络营销、利用网络订货和网络销售，进行的是无纸贸易，用数字签名代替传统印章，签订的是电子合同，出具的是电子发票等，这些不可避免地会带来一系列的法律问题，需要信息产业、流通行业和金融业等方方面面的协同配合，这需要有政府权威部门统一协调，制定近期、中期和长期的电子商务发展规划，从战略上推动我国电子商务的健康发展。
